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深圳企業領銜構建魚類“生命之樹”

2018-05-16 10:29 來源:南方日報 蘇梓威

  近日,由華大海洋和國家基因庫聯合發起的“千種魚類轉錄組”(Fish-T1K)項目正式宣佈構建了迄今為止最可靠的魚類系統演化樹,該成果發表于最新一期的《美國科學院院刊》。這棵魚類“生命之樹”解答了一直以來魚類起源和進化研究中存在的爭論和難題,是魚類演化研究史上的里程碑式事件。

  魚類是人類重要的動物蛋白質來源。作為進化地位古老且物種多樣性豐富的脊椎動物類群,魚類的物種數量佔所有脊椎動物的一半以上。據FishBase數據庫統計,目前已發現的魚類至少33900種。構建魚類“生命之樹”,解析魚類進化歷史,可以找到魚類進化過程中的演變規律,揭示魚類豐富的物種多樣性背後的起因,為魚類種質資源保護和合理開發利用奠定堅實的基礎。

  此次Fish-T1K團隊從整個魚類的不同分類單元中挑選了303種魚類物種,囊括了所有硬骨魚72個目中的66個,佔總分類單元的91.66%。大數據整合了144種魚類的基因組數據和159種魚類的轉錄組數據,採用新的生物信息學分析方法,篩選出1105個直系同源的外顯子序列作為分子標記。

  據了解,Fish-T1K項目成立於2013年11月,旨在完成一千種魚類的轉錄組測序和分析,解密魚類起源、進化、生殖、發育、免疫等多方面的科學問題。目前,該項目已成功吸引了來自7個國家的20多家科研機構的積極參與。

【記者】蘇梓威

編輯: 文海燕
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